Учёные из США создали рабочие геномы вирусов с помощью ИИ — речь о бактериофагах, поражающих бактерии, а не людей. За основу взяли фаг ΦX174 с геномом из 5386 нуклеотидов и 11 генов.
Для проектирования использовались геномные языковые модели Evo 1 и Evo 2. Они предсказывают последовательности нуклеотидов ДНК — по аналогии с тем, как LLM предсказывают следующее слово.
Модели обучили на двух миллионах геномов фагов, затем дообучили на 14 466 последовательностях Microviridae. ИИ генерировал тысячи вариантов генома.
Из 285 синтезированных конструкций 16 оказались жизнеспособными: они размножались внутри E. coli C и вызывали лизис — разрушение бактериальных клеток.
Некоторые вирусы сильно отличались от природных аналогов. Evo-Φ2147 имел лишь 93 % сходства с ближайшим известным фагом — по ряду критериев это отдельный вид.
Цель технологии — борьба с устойчивыми к антибиотикам бактериями. Однако та же технология потенциально позволяет создавать патогены, опасные для человека.